Высшим органом управления Госкорпорации является Наблюдательный совет.

Коллегиальным исполнительным органом Госкорпорации является Правление.

Единоличным исполнительным органом Госкорпорации является Генеральный директор. Он осуществляет руководство ее текущей деятельностью.

Органом контроля за финансово-хозяйственной деятельностью Росатома является Ревизионная комиссия.